Атрий был тет­ра­с­тиль­но­го типа, напо­ми­наю­щий подоб­ные атрии в Пом­пе­ях и Гер­ку­ла­ну­ме. Кры­шу, имев­шую уклон внутрь, под­дер­жи­ва­ли четы­ре колон­ны или пиляст­ра, сто­яв­шие по углам пря­мо­уголь­но­го бас­сей­на (имплю­вия), обли­цо­ван­но­го мра­мор­ны­ми пли­та­ми. Свет про­ни­кал через отвер­стие (ком­плю­вий) в цен­тре кры­ши. Дож­де­вая вода скап­ли­ва­лась в бас­сейне под ним. Избы­ток воды отво­дил­ся по тру­бам в цистер­ны для хра­не­ния. Четы­рем колон­нам, или пиляст­рам, под­дер­жи­вав­шим кры­шу атрия, соот­вет­ст­во­ва­ли деко­ра­тив­ные пиляст­ры, уста­нов­лен­ные пара­ми у север­ной и южной сте­ны атрия. Сте­ны были укра­ше­ны фигур­ной живо­пи­сью, следы кото­рой сохра­ни­лись в восточ­ной части ком­на­ты. В про­ти­во­по­лож­ность ран­не­ита­лий­ской тра­ди­ции, атрий Вил­лы Тесея не сооб­щал­ся с боко­вы­ми ком­на­та­ми, а толь­ко с восточ­ным пор­ти­ком глав­но­го пери­стиль­но­го дво­ра. На полу атрия была гео­мет­ри­че­ская моза­и­ка, клю­че­вым моти­вом кото­рой являл­ся крас­но-бор­до­вый меандр на свет­лом фоне. Моза­и­ка, исполь­зо­вав­ша­я­ся в тече­ние дли­тель­но­го вре­ме­ни, име­ет следы ремон­та, осо­бен­но воз­ле вхо­да. Инте­ре­сен тот факт, что, ремон­ти­руя моза­и­ку в древ­но­сти, масте­ра созда­ли совер­шен­но новые узо­ры, не име­ю­щие ниче­го обще­го с пер­во­на­чаль­ным укра­ше­ни­ем. Это созда­ва­ло впе­чат­ле­ние, что новый ковер с дру­ги­ми узо­ра­ми поло­жи­ли поверх ста­ро­го и изно­шен­но­го. Глу­бо­кая ниша в запад­ной части атрия, веро­ят­но, содер­жа­ла какую-то ста­тую.