Сын М. Юния Брута, плебейского трибуна 83 г. до н. э., и Сервилии (Plut. Brut. 2; Cic. Mil. 16; Brut. 222). В 59 г., по-видимому, был усыновлён по завещанию своим дядей по матери Кв. Сервилием Цепионом (Cic. Att. II. 24. 2; Fam. VII. 21; Phil. X. 25; IG. VII. 383, ср. Geiger 1973, 143—156). В этом же году обвинялся Л. Веттием в подготовке покушения на Помпея, но обвинитель отказался от своих показаний (Cass. Dio XXXVII. 41. 2; Oros. VI. 6. 7; Cic. Att. II. 24). В 58—56 гг. сопровождал своего дядю М. Катона в поездке на Кипр (Plut. Brut. 3; Cat. Min. 36). В 54 г. монетарий, чеканил монеты с портретами своих предков Луция Брута и Сервилия Агалы (RRC. 433). В 53 г. занимал должность квестора; отказался поехать к Цезарю в Галлию и отправился в Киликию вместе со своим тестем Ап. Клавдием; занимался на Кипре ростовщической деятельностью при посредничестве М. Скапция и Л. Гавия (Cic. Att. V. 21. 10; VI. 1. 4—6; 2. 8; 3. 5—6; Auc. Vir. Ill. 82. 3—4). Около 51 г. вошёл в коллегию понтификов (Cic. Ad Brut. I. 5. 3; 15. 8). В 50 г. защищал Ап. Клавдия от обвинения в вымогательстве (Cic. Fam. III. 10. 2; 11. 1—3; Att. VI. 2. 10).
С началом гражданской войны в 49 г. встал на сторону Помпея, служил легатом Сестия в Киликии; затем отправился к Помпею в Македонию; после поражения при Фарсале сдался и был помилован Цезарем (Plut. Brut. 4—6). В 46—45 гг. по поручению Цезаря управлял Цизальпийской Галлией в должности легата, возможно, пропретора (Cic. Fam. VI. 6. 10; XIII. 10—14; Brut. 171; Att. XII. 27. 3; Plut. Brut. 61. 6—7; App. BC. II. 111). В 44 г. был назначен Цезарем на должность городского претора (Cic. Att. XV. 12. 1; 18. 2; XVI. 1. 1; 2. 3; 4. 1; Fam. VII. 21; Phil. X. 7; Vell. II. 58. 1; Plut. Caes. 57. 3; 62. 2; Brut. 7; 14. 4—5; App. BC. II. 112; IV. 57; Cass. Dio XLIV. 12. 3; 15. 4).
В начале 44 г. вступил в заговор против Цезаря и 15 марта 44 г. совместно с другими заговорщиками убил его (Plut. Brut. 8—12; 18—19; App. BC. II. 113—115; Nic. Dam. Vita Caes. 24; Cass. Dio XLIV. 14. 2; Eutrop. VI. 25; Auc. Vir. Ill. 83; Oros. VI. 17. 2). Сенат объявил амнистию всем соучастникам; но вследствие усиления Антония и роста ненависти населения Рима к заговорщикам Брут вместе с Кассием в апреле вынужден был покинуть Рим. Некоторое время он находился в Италии, передав обязанности городского претора Гаю Антонию. В июне сенат поручил Бруту попечение о поставах зерна из Азии; в августе назначил его проконсулом Крита (Cic. Att. XIV. 4. 1; 5. 1; 7. 1; 10. 1; XV. 4. 2; 10; 11. 1—2; 12. 1; 20. 2; XVI. 2. 4; 3. 6; Fam. XI. 1; Phil. II. 97; X. 7—8; XI. 27; Plut. Brut. 18—20; Caes. 67—68; Cic. 42; Ant. 14—15; App. BC. II. 148; III. 2, 8, 12, 16, 23, 35; Flor. II. 17. 1; Cass. Dio XLV. 32. 4; XLVI. 23. 3; XLVII. 20—21; Auc. Vir. Ill. 82. 6).
Предвидя неизбежность вооружённого столкновения с цезарианцами, в августе 44 г. Брут покинул Италию, направился в Македонию и приступил к набору войска среди римлян, обучавшихся в Афинах; получил значительные финансовые подкрепления от М. Аппулея и Г. Антистия Вета, квесторов Азии и Сирии. В начале 43 г. занял всю Македонию и Иллирик, осадил в Аполлонии проконсула Г. Антония и принудил его сдаться. Получив известие об этом, сенат по предложению Цицерона легитимизировал положение Брута, назначив его проконсулом Македонии, Ахайи и Иллирика. Позднее, вероятно, Брут получил верховный империй, распространяющийся и на Азию. В переписке категорически возражал против предоставления почестей Цезарю Октавиану, однако не стал вмешиваться в события в Италии и направился на Восток, продолжая собирать войска. Был провозглашён императором за победы во Фракии (Cic. Att. XVI. 7; Phil. I. 8—10; X. 9—13, 23—24, 26; XI. 26—27; XIII. 30—32; Ad Brut. I. 2. 2, 3; 4. 5; 9—12; 14—18; II. 1—5; Liv. Per. 122; Vell. II. 62; Plut. Brut. 24—27; Cic. 45. 1; App. BC. III. 24, 63—64, 79; IV. 58, 75; Cass. Dio XLVI. 40. 3; XLVII. 21—25)
В августе 43 г. Брут и другие убийцы Цезаря были объявлены врагами государства по закону Кв. Педия, консула-суффекта, получившего эту должность вместе с Цезарем Октавианом (RGDA 2; Liv. Per. 120; Vell. II. 69. 5; App. BC. III. 95; IV. 27; Cass. Dio XLVI. 48—49; XLVII. 22. 4). Зимой 43/42 гг. Брут переправился в Азию, встретился с Кассием в Смирне, покорил ликийцев, везде собирая войска и деньги. Армии Брута и Кассия соединились в Сардах и переправились в Македонию для борьбы с объединёнными силами Антония и Октавиана. В первом сражении при Филиппах Брут разгромил армию Октавиана, но второе проиграл и покончил с собой 23 октября 42 г. (Liv. Per. 122—124; Vell. II. 69—72; Plut. Brut. 24; 28—53; Ant. 22; App. BC. IV. 65; 76—81; 87—114; 117—135; Flor. II. 17; Cass. Dio XLVII. 32—49; Eutrop. VII. 3; Oros. VI. 18. 13—16).